重症肌無力的常見臨床表現為上瞼下垂、咀嚼吞嚥困難、四肢乏力等，病情嚴重時可發生重症肌無力危象危及患者生命，對待病情不同的患者可採用不同治療方案，以下臨床上常用的四種治療方案。
首選方案：胸腺切除術，若術後病情明顯惡化，可輔以血漿置換、大劑量注射免疫球蛋白、激素和膽鹼酯酶抑制劑等治療。
次選方案：病情嚴重不能胸腺切除者可用血漿置換或大劑量注射免疫球蛋白，配合激素，逐漸過渡到單用激素，病情好轉且穩定2個月後行胸腺切除，術後維持原劑量2個月，再緩慢減量2～4年直至停用。
第三方案：不能或拒絕胸腺切除的重症肌無力患者和危重者首選血漿置換或大劑量注射免疫球蛋白，非危重者首選激素治療，在激素減量過程中可適量加用硫唑嘌呤等免疫抑制劑，減輕反跳現象。
第四方案：不能或拒絕行胸腺切除者，同時又拒絕或不能耐受激素治療的重症肌無力患者，可選用硫唑嘌呤、嗎替麥考酚酯、環孢素、他克莫司、環磷醯胺或利妥昔單抗等免疫抑制劑治療。