在決定大腸癌療效的眾多因素中，腫瘤的臨床分期是最重要的，此外，腫瘤的病理型別、患者的年齡、腫瘤的部和等對大腸癌的預後有著不同程度的影響。
1、臨床分期
大腸癌的早發現、早診斷和早治療對預後影響非常大。早期的由於患者初病，體質尚佳，癌腫尚未轉移，康復的機率高。反之，則病期晚則預後差。
2、腫瘤的病理型別
腫瘤病理型別的高、中、低分化在決定患者的預後生存率中也有重要的作用，低分化腫瘤的術後5年生存率低於高、中分化者。
3、年齡
年齡小的大腸癌患者的預後較差，同時年輕患者的臨床症狀不明顯，確診是多為晚期，且多是分化程度較低的粘液腺癌。
4、性別
由於男女在解剖生理上的差異，預後也有所不同，女性大腸癌患者的預後一般比男性差。
5、腫瘤的部位
不少研究發現結腸癌的預後比直腸癌好，在有淋巴結轉移的Dukes'C期病人中結腸癌預後明顯優於直腸癌。直腸癌的預後也與病灶位置關係密切，無症狀(如普查時發現)患者的預後顯著優於有症狀者。