入職體檢是專項體檢之一，旨在通過體檢保證入職員工的身體狀況適合從事該專業工作，在集體生活中不會造成傳染病流行，不會因其個人身體原因影響他人。入職體檢有相對固定的體檢專案與體檢標準，選擇專業體檢中心能保證體檢質量。但由於入職體檢內容較為簡單，所以不能完全代替健康體檢。
1.入職體檢簡單性。
為節約成本，單位安排的體檢一般採用的是較為廉價專案、裝置、儀器和試劑，從而會大大影響資料的精確性。
2.入職體檢片面性。
單位安排的體檢一般是根據單位的工作性質而設定的專案，並不是依據國際WHO的五項原則而設定的，因此單位體檢關心的公司的利益而並非是自身的身體健康狀況。