正常尿內晶體飽和度和晶體聚合抑制因子的活性兩者處於平衡狀態，一旦由於某種因素破壞了這種平衡，不管是前者飽和度過高，或是後者活性降低，均可引起尿內晶體聚合，導致尿石形成。下列因素對尿石的成因有明顯的誘發作用。
1、全身性因素：新陳代謝紊亂、飲食與營養、長期臥床、生活環境、精神、性別、遺傳因素。
2、泌尿系統的區域性因素：尿路感染、尿路慢性硬阻、異物。
膽石形成原因迄今仍未完全明確，可能為一綜合因素。膽石的成分有膽固醇、膽色素、鈣鹽、黏蛋白及其他有機物與無機物等，根據結石成分的不同，通常將膽石分為膽固醇性結石、膽色素性結石和混合性結石（膽固醇、膽色素、鈣及其他有機物、無機物混合而成）3類。多年來的研究已證明，膽石是在多種因素影響下，經過一系列病理生理過程而形成的，這些因素包括膽汁成分的改變、過飽和膽汁或膽固醇呈過飽和狀態、膽汁囊泡及膽固醇單水晶體的沉澱、促成核因子與抗成核因子的失調、膽囊功能異常、氧自由基的參與及膽道細菌、寄生蟲感染等。