1.前列腺癌 血尿癌腫浸潤膀胱時出現，經直腸指診、B超、CT、活組織檢查等明確。
2.腎、輸尿管腫瘤 血尿特點也為全程無痛性肉眼血尿，與膀胱癌類似，可單獨發生或與膀胱癌同時發生，上尿路腫瘤引起的血尿可出現條形或蚯蚓狀血塊，明確診斷需要B超、CT、泌尿造影等檢查。
3.前列腺增生 主要症狀為進行性排尿困難及尿頻，有時出現肉眼血尿，在老年人，膀胱癌可以和前列腺增生同時存在，需要行尿脫落細胞學、B超、CT、膀胱鏡檢查等鑑別。
4.腺性膀胱炎 有明顯的膀胱刺激症狀，需要膀胱鏡檢及活檢，單純膀胱鏡檢有時誤診。
5.尿石症 血尿多為鏡下血尿，上尿路結石可出現腎、輸尿管絞痛，膀胱結石可出現排尿中斷現象，通過KUB平片、B超、膀胱鏡檢查等鑑別，由於膀胱結石對區域性粘膜的刺激，可導致腫瘤發生。因此，長期膀胱結石出現血尿時，應想到膀胱癌的可能，必要時行膀胱鏡檢查及活檢。
6.其他 如放射性膀胱炎(多有盆腔放療史，膀胱鏡下有放射狀毛細血管擴張、膀胱粘膜潰瘍及肉芽腫，需行活檢確診)，子宮頸癌(侵人膀胱後可出現血尿，但一般先有陰道出血，陰道檢查可鑑別)等。
7.泌尿繫結核 除了血尿外，主要症狀為慢性膀胱刺激症狀，伴有低若熱、盜汗、消瘦、乏力等全身症狀，通過尿找抗酸桿菌、IVP、膀胱鏡檢查等與膀胱癌鑑別。