正常的男性生殖檢查包括四大項：
男性生殖器檢查陰莖是否損傷
根據外傷史及區域性表現常可作出正確診斷，通常無需特殊檢查。海綿體造影可體現海綿體損傷的部位及程度。
男性生殖器檢查陰囊
在體表外，損傷的部位，程度容易診斷，超聲檢查有助於正確判斷陰囊血腫和確定睪丸是否損傷;有助於確定外科手術探查適應證，如睪丸破裂、異物存留。
通過病史、體檢
男性生殖器檢查陰囊內睪丸的大小和質地很重要。附睪有無硬結常代表附睪有沒有發生過炎症或結核，圓形的腫塊很可能是精液囊腫可妨礙附睪管的暢通。附睪飽滿而精液中沒有精子可能是阻塞性無精子症。有無精索靜脈曲張也是重要檢查內容。
前列腺的檢查
通過肛門指檢，可在直腸前壁摸到前列腺，根據它的大小、質地、有無壓痛可以初步判斷前列腺有無問題，必要時可作前列腺按摩取液以進行化驗檢查。精囊正常時常觸控不到，但在有炎症增大時有時可以在前列腺上部摸到有壓痛的精囊。