關於兒童病毒性腦膜炎的治療，一定要結合實際情況來進行分析。如果病因是一些單純皰疹病毒感染所導致的，就可以選用一些阿昔洛韋來進行抗病毒處理。如果是其他的病毒感染所導致的腦膜炎，目前並沒有特效的抗病毒的藥物。一般來說，如果患兒的免疫系統正常的話，基本上都能夠康復的。
除了針對病因治療之外，還需要進行對症治療，比如可以口服一些對乙醯氨基酚或者是使用酸氣來減輕發燒、退燒，也可以進行物理降溫，頭痛的時候可以適當的用一些鎮痛的藥物，必要的時候可以適當的用一些降顱壓的藥物。大部分的病毒性腦膜炎都能夠完全痊癒，不會留下後遺症，一般是不需要長期用藥。