肥胖的原因迄今尚未完全闡明，一般認為與下列因素有關。
（1）遺傳：父母中有一位是肥胖者，其子女肥胖機率為40%至50%；父母皆為肥胖者，其子女肥胖機率為70%至80%。
（2）飲食習慣：若家長任由孩童吃高脂及高熱量食物，而且經常要他們吃光所提供的食物，甚至以獎勵方式來鼓勵孩子吃東西，容易令孩子變得肥胖。
（3）心理代償作用：當兒童心理不安、緊張或受挫折時，會找來甜食、高熱量食物，以不斷進食來填補心理不安，養成進食過量的習慣。
（4）服用藥物：如抗過敏藥物、性激素、類固醇、抗抑鬱藥、抗癲癇藥等。
（5）生理因素：可能源自於患者本身的新陳代謝較亢進，內分泌失調、染色體異常、大腦控制飽食飢餓中樞失控或疾病等因素。